在悉尼马拉松比赛中，约四万名跑步者参赛期间，出现了针对以色列人的仇恨标语和指控性信息。参赛的以色列人多为退役军人，他们代表Shalva慈善机构参赛以筹集资金。Shalva是一个为犹太人、穆斯林、基督徒和德鲁兹以色列人服务的残障非政府组织。
2026悉尼马拉松的完赛奖牌出现设计失误，奖牌背面错误地刻有德国慕尼黑的安联球场图案，而非悉尼的安联体育场。马拉松组织方承认了这一错误，表示"国际风味过浓被不小心加入了完赛奖牌的背面，显示了对体育场的错误描绘"。尽管存在此瑕疵，组织方仍决定将这些奖牌发放给参赛者。
2026年悉尼马拉松的参赛奖牌上出现了一处地理错误。组织方在奖牌上错误地刻入了德国慕尼黑的安联竞技场（Allianz Arena），而非赛道沿途经过的悉尼安联体育场（Allianz Stadium）。这批超过40,000枚奖牌将颁发给8月30日完成42.2公里赛程的参赛者。